您的位置:首頁(yè) > 資訊 > 科技 >
日本個(gè)研究小組開發(fā)新方法,可全面檢測(cè)細(xì)胞核內(nèi)RNA和基因組DNA之間的相互作用
來源:科技日?qǐng)?bào) 2020-02-27 17:21:41

日本理化學(xué)研究所的一個(gè)研究小組開發(fā)出稱為“RADICL-seq”(RNA And DNA Interacting Complexes Ligated And sequence)的方法,可在整個(gè)基因組中全面檢測(cè)細(xì)胞核內(nèi)RNA和基因組DNA(染色質(zhì))之間的相互作用。

科學(xué)家對(duì)很多被稱為“長(zhǎng)鏈非編碼RNA (lncRNA)”在內(nèi)的RNA功能尚不了解。而了解RNA功能,必須了解由DNA和組蛋白組成的染色質(zhì)區(qū)域與RNA的相互作用。

從DNA轉(zhuǎn)錄的RNA分為兩種,一種是具有制造蛋白質(zhì)信息的信使RNA(mRNA),另一種是不具備制造蛋白質(zhì)信息的非編碼RNA(ncRNA,非編碼RNA)。在ncRNA中,長(zhǎng)度超過200個(gè)堿基的RNA被稱為“長(zhǎng)鏈非編碼RNA”。ncRNA的一部分參與體內(nèi)的各種過程,包括轉(zhuǎn)錄和翻譯,以及通過由DNA和組蛋白組成的“染色質(zhì)”的結(jié)構(gòu)變化調(diào)節(jié)基因表達(dá)(染色質(zhì)重塑)。

新方法首先用甲醛固定細(xì)胞核內(nèi)存在的RNA、蛋白質(zhì)和DNA,然后通過獨(dú)特設(shè)計(jì)的銜接子序列連接RNA和DNA。之后去除固定的蛋白質(zhì),僅提取結(jié)合到銜接子的RNA和DNA。通過下一代基因測(cè)序器讀取這些基因,然后將其定位到基因組中。這樣可全面了解附近存在的DNA和RNA。

研究小組開發(fā)的方法可以同時(shí)捕獲各種核RNA的信息,包括在調(diào)節(jié)基因組DNA的基因表達(dá)和維持染色質(zhì)結(jié)構(gòu)中起重要作用的RNA,以及與它們相互作用的基因組區(qū)域。通過這種方法獲得的數(shù)據(jù)還可以用于檢查染色質(zhì)如何組織和調(diào)節(jié),并提供lncRNA功能的全面評(píng)估。今后有望作為研究核內(nèi)RNA的技術(shù)被廣泛應(yīng)用。

研究成果2月24日發(fā)表在《自然通訊》雜志上。(記者 陳超)

關(guān)鍵詞: RNA 基因組
相關(guān)文章

修復(fù)RNA脫靶的“漏洞”,我國(guó)科學(xué)家開發(fā)出新一代

科技日?qǐng)?bào)上海6月10日電 (侯樹文記者王春)近日,中國(guó)科學(xué)院腦科學(xué)與智能技術(shù)卓越創(chuàng)新中心楊輝研究組的一項(xiàng)研究首次證明了BE3、BE3-hA3A和AB更多

2019-06-11 11:41:19

中國(guó)科學(xué)家將主導(dǎo)基因組標(biāo)簽計(jì)劃,協(xié)作完成復(fù)雜的

記者 張佳星國(guó)際合作的人類基因組計(jì)劃(HGP)耗時(shí)13年、花費(fèi)30億美元通讀了人類遺傳密碼,但很多生命問題仍然無解。例如基因組相同,細(xì)胞卻更多

2019-05-24 15:24:27

我國(guó)首次解析了人類皰疹病毒基因組包裝的關(guān)鍵機(jī)制

5月30日,《自然》雜志在線發(fā)表了中國(guó)科大合肥微尺度物質(zhì)科學(xué)國(guó)家研究中心、生命科學(xué)學(xué)院劉云濤博士、畢國(guó)強(qiáng)教授與合作者的研究論文。他們更多

2019-05-31 15:17:34

我國(guó)成功構(gòu)建熱帶玉米基因組及高精度結(jié)構(gòu)變異圖譜

科技日?qǐng)?bào)武漢6月10日電 (記者劉志偉 通訊員蔣朝常楊寧)記者10日從華中農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉,由該校嚴(yán)建兵教授主導(dǎo)、華大基因等參與的科研團(tuán)隊(duì)成更多

2019-06-11 15:03:40

古代個(gè)體的基因組數(shù)據(jù)“講述”早期人類遷移史

科技日?qǐng)?bào)北京6月13日電 (記者張夢(mèng)然)英國(guó)《自然》雜志近日發(fā)表了兩項(xiàng)基因組學(xué)重磅研究,歐洲兩個(gè)研究團(tuán)隊(duì)報(bào)告了古代個(gè)體的基因組數(shù)據(jù),其更多

2019-06-14 14:34:19

我國(guó)首次在全球完成草地貪夜蛾染色體基因組測(cè)序和

從蟲卵到成蟲,20天左右就完成一個(gè)世代。遷飛速度快、繁殖力強(qiáng)、食量特別大是入侵物種草地貪夜蛾的標(biāo)簽。這種幺蛾子取食玉米、水稻、高粱等更多

2019-06-19 13:52:21

基因組測(cè)序“黑科技”,加速生命數(shù)字化的進(jìn)程

測(cè)序技術(shù)抓住了生命科學(xué)技術(shù)的龍頭,基因組測(cè)序成本從最初的3000萬美元下降到1000美元甚至更低,使得每個(gè)人都可能為自己進(jìn)行基因組測(cè)序,這更多

2019-06-25 13:37:36

國(guó)際團(tuán)隊(duì)完成了迄今覆蓋面最廣泛的癌癥全基因組分

英國(guó)韋爾科姆基金會(huì)桑格研究所近日宣布,一個(gè)國(guó)際團(tuán)隊(duì)完成了迄今覆蓋面最廣泛的癌癥全基因組分析,這有助于加深研究人員對(duì)癌癥的認(rèn)識(shí),為開更多

2020-02-11 13:33:51

我國(guó)科研團(tuán)隊(duì)自主研發(fā)完成海灣扇貝兩個(gè)亞種的基因

25日,記者從青島農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉,該校海洋科學(xué)與工程學(xué)院王春德教授課題組與合作單位自主研發(fā)完成海灣扇貝兩個(gè)亞種的基因組測(cè)序和組裝。近日更多

2020-03-26 14:51:02
熱門
關(guān)注